Es para desarrollar herramientas de software de código abierto para comprender los sistemas biológicos y descubrir nuevos medicamentos
(BUSINESS WIRE)-Los fundadores del consorcio sin fines de lucro también anuncian el lanzamiento de su primer modelo de IA para predecir estructuras de proteínas
Un conjunto de socios académicos y de la industria líderes anuncian la formación de OpenFold, un consorcio de organizaciones de investigación de inteligencia artificial (IA) sin fines de lucro cuyo objetivo es desarrollar software libre y de código abierto herramientas para la biología y el descubrimiento de fármacos. OpenFold es un proyecto de Open Molecular Software Foundation (OMSF), una organización sin fines de lucro que promueve las ciencias moleculares mediante la creación de comunidades para el desarrollo de software de investigación de código abierto.
Los miembros fundadores de OpenFold son el Laboratorio de la Universidad de Columbia de Mohammed AlQuraishi, Ph.D. , Arzeda , Cyrus Biotechnology , Prescient Design de Genentech y Outpace Bio . El consorcio, cuya membresía está abierta a otras organizaciones, está alojado por OMSF y respaldado por Amazon Web Services (AWS) como parte del Programa de patrocinio de datos abiertos de AWS . OMSF también alberga OpenFreeEnergy y OpenForceField .
Brian Weitzner, Doctor en Filosofía. El director asociado de Biología Estructural y Computacional de Outpace y cofundador de OpenFold dijo: “En biología, la estructura y la función están indisolublemente unidas, por lo que se requiere una comprensión profunda de la estructura para dilucidar los mecanismos moleculares y diseñar sistemas biológicos. Creemos que la colaboración abierta y el acceso a poderosas herramientas de biología estructural impulsadas por IA transformarán la biotecnología y las biociencias al empoderar a investigadores y educadores que abarcan compañías de ciencias de la vida, compañías tecnológicas y académicos con acceso gratuito para usar y ampliar estas herramientas para acelerar el descubrimiento y desarrollar biotecnología, tecnologías cambiantes”.
La primera área de investigación importante para el consorcio es crear herramientas de modelado de proteínas basadas en IA de última generación que puedan predecir estructuras moleculares con precisión atómica. El consorcio OpenFold sigue el modelo de consorcios de código abierto de la industria tecnológica precompetitiva, como Linux y OpenAI.
Primer modelo de IA lanzado por un consorcio para predecir la estructura de proteínas con resultados impresionantes
Los fundadores de OpenFold también anunciaron oficialmente hoy el lanzamiento completo de su primer modelo de IA de predicción de estructuras de proteínas desarrollado en el laboratorio del Dr. AlQuraishi, reconocido públicamente por primera vez en Twitter el 22 de junio de 2022. El modelo se basa en el trabajo innovador de Google DeepMind y el Instituto de Diseño de Proteínas de la Universidad de Washington. El software está disponible bajo una licencia gratuita y de código abierto de The Apache Software Foundation en https://github.com/aqlaboratory/openfold. Los datos de capacitación se pueden encontrar en el Registro de datos abiertos en AWS. Próximamente se realizará una preimpresión y una publicación formales.
Yih-En Andrew Ban, Ph.D., VP Computing en Arzeda y cofundador de OpenFold dijo: “Este primer modelo OpenFold AI ya está produciendo predicciones altamente precisas de estructuras cristalinas de proteínas como se compara en la evaluación continua del modelo automatizado (CAMEO) , y ha producido una mayor precisión en promedio y tiempos de ejecución más rápidos que AlphaFold2 de DeepMind ”. En la figura se incluye un resultado de ejemplo de OpenFold, con una comparación con los datos experimentales.
CAMEO es un proyecto desarrollado por la comunidad científica de predicción de estructura de proteínas para evaluar la precisión y confiabilidad de las predicciones.
Lucas Nivon, Ph.D., CEO de Cyrus y cofundador de OpenFold, dijo: “La primera versión del software OpenFold incluye no solo el código de inferencia y los parámetros del modelo, sino también el código de capacitación completo, un paquete completo que no ha sido lanzado por otra entidad en el espacio. Permitirá entrenar un conjunto completo de modelos derivados para usos especializados en el descubrimiento de fármacos de productos biológicos, moléculas pequeñas y otras modalidades”.
Los investigadores de todo el mundo podrán usar, mejorar y contribuir a lo que los fundadores del consorcio describen como su «microscopio molecular predictivo». El trabajo actual y futuro ampliará estos modelos derivados para integrarlos con otro software en el campo y para que sean más útiles para el diseño de proteínas y el descubrimiento de fármacos biológicos específicamente.
Richard Bonneau, Ph.D., director ejecutivo de Prescient Design de Genentech, dijo: “OpenFold es muchas cosas para nosotros, un código, un foro, ¡un grupo de grandes mentes para discutir nuestros temas favoritos! ¡Hasta ahora ha sido una experiencia maravillosa y estamos muy emocionados de construir las próximas etapas de la hoja de ruta!”
Muchas otras organizaciones corporativas y sin fines de lucro se están uniendo actualmente al consorcio OpenFold como miembros de pleno derecho, y los fundadores invitan a unirse a organizaciones de biotecnología, farmacéutica, tecnología y otras organizaciones de investigación. Actualmente, el consorcio está evaluando propuestas para nuevos proyectos de proteínas de IA de grupos académicos de todo el mundo.
Acerca de OpenFold
OpenFold es un consorcio de investigación de inteligencia artificial (IA) sin fines de lucro de socios académicos e industriales cuyo objetivo es desarrollar herramientas de software gratuitas y de código abierto para biología y el descubrimiento de fármacos, alojado como un proyecto de Open Molecular Software Foundation.
